携三代测序和生物云平台为疫情抗击免费提供技术支持,百迈客在行动!

 

新型冠状病毒疫情对我国人民的生产生活产生了较大影响,牵动着大家的心。举国上下都十分重视,我们的一线医护人员冲在了抗击疫情的最前线,大家也都从各方面提供着各种援助,充分体现了我们一方有难八方支援的优良传统。

作为一种新型冠状病毒,我们对它的了解还不够,我们的临床科学家们也在想尽各种办法加班加点研究这种新型冠状病毒,以便尽快研究清楚它的生物学分子机理,正如1月26日,在国务院新闻办疫情新闻发布会上,中国疾病预防控制中心主任高福院士表示的,要结合多种技术手段来帮助做病毒的解析。百迈客作为三代测序和生物云服务提供商,结合自身的技术特点,也积极的参与到抗击疫情的战斗中,用自己的技术为抗击疫情贡献一份力量。

针对此次疫情,百迈客积极与一线的医护和科研人员合作,结合一线的需求,积极调动各种资源,经过十几天夜以继日的开发,终于把第一版新型冠状病毒(nCov)基因组数据库分析平台上线,为我们的一线科研人员提供免费服务。现把阶段性开发进展和支持方式公布如下,希望对加快破解和管控疫情提供有效支撑:

1 “病毒数据库&自动化分析平台/工具” 向社会免费共享

自2019年12月疫情首现以来,百迈客研发团队及时跟进疫情研究进展。目前已完成一期研发计划,我们通过对各数据库中的新型冠状病毒数据进行合理整合分析,及时搭建了首版“新型冠状病毒数据库分析平台”(http://ncovdb。biocloud。net/home) ,本数据库于2020年1月27日20:00时正式上线。本数据库将配合国家公共资源数据库为社会提供更全面、及时、准确的数据资源。

数据库部署了31个新型冠状病毒基因组序列,其中MN938384、MN908947、MN975262等菌株均已补充详细的基因组、编码基因及蛋白序列信息,我们还基于这31个菌株,2株MERS作为外源构建了物种进化树,以便更清晰解读新型冠状病毒的进化树起源。研究人员可便捷下载基因组数据资源,亦可通过我们部署的Blast、GBrowse、Primer Design 等工具完成相关的初步数据分析、挖掘。
我们将持续跟进、并更新该数据库,为国内外科研工作者提供方便快捷的数据检索及下载服务。在随后的二期、三期研究计划中,我们会继续部署各种自动化分析工具,分析保守域、菌株间的变异信息,寻找菌株间的共性的突变信息,为病毒致病机理的研究、疫苗的开发等提供技术支持。

2三代纳米孔技术助力病毒变异监测

三代测序技术作为基因组学研究的新兴技术,对病毒的组学研究有着重要作用,作为全球领先的三代测序技术服务提供商,百迈客生物与战略合作伙伴Oxford Nanopore公司联合协调了5套MinION测序平台及配套试剂盒,各位疫情防控专家如有需求,联系评估后随时无偿配发,保证前线专家做好对疫情的实时监控、及时分析;如有建好的2019-nCov病毒测序文库也可以结合送样要求,联系我们。
附录:样品要求

3、已配备专业生物信息分析团队,并向社会无偿提供信息分析技术支持
疫情爆发以来,我们组织20余人的生信分析团队提前结束假期,不断针对发布的病毒基因组进行研究分析,随时待命加入抗击疫情的队伍。同时,百迈客亦诚恳邀请、欢迎各位专家学者共同探讨疫情防控良策,请联系18514282648(微信同号)进群讨论。

4、其它可调配资源
如果前线专家需要其它生物技术支持资源,百迈客生物将不遗余力提供最大的帮助。

 

24小时对接联系人:

I.数据库使用&数据分析对接人:王老师

手机:18514282648(同微信)邮箱:wangf@zjpjr.com

II。样品准备&测序对接人:康老师

手机:16622926288(同微信)邮箱:kangjm@zjpjr.com

我们将全力协调公司各种资源,在基因组变异与进化,病毒感染与致病机理分析,病毒溯源等方面为国为民贡献一份“微薄”之力,在生命的赛道上,分秒必争!疫情防控无小事,从你我做起。

 

加油武汉!加油中国!
百迈客生物
2020年1月27日
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